Repræsentantskabet er organisationens øverste myndighed. Bestyrelsen og den nationale leder udgør ledelsen. Der er en tæt forbindelse til det Europæiske Teen Challenge (ETC), som er forbundet til Globel Teen Challenge. Teen Challenge i Danmark består af selvstændige arbejder rundt i landet. Det betyder, at der ikke er en fælles økonomi. Teen Challenge er ikke en organisation, der går ind og styrer direkte. Ledelsen har derimod taleret ind i det enkelte arbejde, hvorved behandlingsmodellen fastholdes.